Akvaryum giderlerini iki bölümde düşünebilirsiniz: 1:  Kuruluş 2: İşletme giderleri. Soğuksu ve tropikal akvaryum giderlerinde ısıtma giderleri fark eder, bir de tesisata %15 kadar bir artış öngörülür(tropikal akvaryumlarda.). Tropikal akvaryum balıkları pahalı olduğundan kuruluş giderlerinde artış yaratır. Uçak taşıma ücretleri, balık yakalama zorlukları, beslenmeleri, ender bulunmaları akvaryum giderlerini arttırır. Akvaryum için mercan umu, sentetik deniz suyu karışımı, giderleri arttırıcı unsur sayılır. Soğuk deniz akvaryumu ise bir bardak su fiyatı gibi ucuzdur.

Akvaryumun kuruluşu üzerine, işletme giderleri fazla tutmaz, tropikal akvaryumda bile bu böyledir. Isı kontrolüne riayet edilirse masraflar kısılmış olurken, geceleri kapatılan ışıkla da giderler azaltılabilir. Balık için belirli bir ısı derecesi sağlanınca, ısı devamlılığı için fazla gidere gerek kalmaz. Hava pompası ve filtreler sürekli alışsa bile, günde birkaç vat elektrik bu işe yeterlidir. Diğer taraftan, canlı yem yakalamak, üretmek, ev artıklarını değerlendirmekle de besi giderleri kısılabilir.